Offre de stage 2026 - Modélisation de pathogènes et visualisation automatisée
- 20 févr.
- 3 min de lecture
Phloème est une entreprise de conseil en viticulture résolument engagée dans la transition écologique et en pointe sur l’analyse des données en viticulture. Elle accompagne environ 200 viticulteurs sur près de 8 000 hectares de vigne en Gironde, Charentes et Val de Loire.
Phloème utilise des modèles épidémiologiques ou statistiques de développement des maladies et ravageurs de la vigne. Les conséquences du changement climatique sur la biologie des parasites rendent ces modèles « obsolètes » et nécessite une actualisation.
Au cours des suivis et accompagnements techniques que réalisent l’équipe de 8 ingénieurs et techniciens de l’entreprise, de très nombreuses observations sont réalisées grâce à des outils numériques conçus et calibrés pour produire des données fiables, géolocalisées et reproductibles. Ces données d’observations sur 5 années (2021 à 2025) constituent des séries sur environ 3 300 parcelles et 11 000 données par an soit pas loin de 60 000 observations.
Missions
Dans le prolongement d’un travail initié en 2025 sur la modélisation statistique et stochastique des maladies de la vigne, le ou la stagiaire aura pour mission de contribuer à l’amélioration et à l’enrichissement de nos modèles internes de prévision épidémiologique.
Les missions principales seront les suivantes :
➡️ Amélioration du modèle de simulation du cycle du mildiou. Affiner le modèle existant afin d’améliorer la détection et la précision des contaminations secondaires. Optimiser les calculs d’humectation et de durée d’humectation, en modifiant la méthode d'estimation.
➡️ Intégration de nouveaux paramètres agronomiques au modèle. Ajouter et tester de nouveaux paramètres explicatifs tels que la hauteur des ceps, le Leaf Wall Area (LWA) en cours de saison, les stades de sensibilité des cépages.
➡️ Évaluation de l’apport de ces paramètres sur la performance prédictive du modèle. Etudier les stades de sensibilité par cépage et par organe. Exploiter et analyser les données issues des campagnes 2024 et 2025, sur la base du référentiel établi en 2023. Identifier les stades de sensibilités pour chaque organe (feuilles, grappes) selon les cépages (avec prise en comptes des variables secteur géographique et mode de culture). Produire des recommandations de modélisation à intégrer dans nos outils de prévision. Améliorer le modèle d’estimation des stades phénologiques. Renforcer la robustesse du modèle en s’appuyant sur l’historique des données. Contribuer au développement d’autres modèles internes. Participer à la conception ou à l’amélioration de modèles sur d’autres pathogènes ou ravageurs, tels que le botrytis, le black‑rot ou les tordeuses. Tester des prototypes, proposer des évolutions et documenter les méthodologies associées.
Intérêt du stage
Ce stage sera encadré par un responsable technique et le responsable des outils numériques de l’entreprise.
Il permettra ainsi à l’étudiant(e) d’acquérir une bonne expérience des enjeux en matière de prédiction de risques en contexte agronomique. Il possèdera également une bonne expérience de mise en œuvre d’outils numériques au service de professionnels de la viticulture.
Profil du candidat
Le stage s’adresse à des étudiants de Master 2 ou de 3e année en école d’ingénieur en statistiques ou sciences des données. Formation en data science / statistiques / mathématiques appliquées/informatique / data engineering
Nous recherchons un(e) stagiaire disposant d’un profil hybride entre data science et développement applicatif, capable de reprendre et faire évoluer une application de visualisation de données existante développée en Python avec Dash.
Le ou la stagiaire devra être à l’aise avec la manipulation de données, la visualisation interactive et la compréhension d’un environnement technique déjà structuré (base de données, ETL, conteneurisation).
Compétences techniques attendues :
Très bonne maîtrise de Python,
Expérience avec Dash et Plotly pour la création et l’adaptation de tableaux de bord interactifs,
Bonne pratique de la manipulation de données (pandas, numpy),
Connaissances en SQL, en particulier PostgreSQL,
Compréhension des enjeux de performance et de volume de données,
À l’aise avec Docker et docker-compose pour travailler dans un environnement applicatif existant,
Sensibilité data & scientifique.
Le / la stagiaire devra être capable de :
Comprendre des indicateurs et indices issus de données agronomiques et météorologiques,
Manipuler des séries temporelles et des données spatialisées,
adopter une démarche rigoureuse dans l’analyse et la visualisation des résultats (hypothèses, limites, reproductibilité).
Qualités personnelles :
Autonomie,
Curiosité technique,
Capacité à intégrer des retours utilisateurs métier pour faire évoluer les visualisations.
Conditions de travail
📅 Durée : 6 mois à partir du printemps 2026 – 35 heures hebdomadaire
💰 Rémunération : 750 €/mois
💻 Ordinateur de travail fourni
Pour candidater
📨 Les candidatures (CV + lettre de motivation) sont à adresser et à transmettre par email à Tristan Roze des Ordons : tdesordons@phloeme-conseil.com avant le 15/03/2026.
📞 Pour plus d'informations, contactez Tristan au 06 03 01 13 04.
